外皮（住宅の外気に接する面積）が少ない住宅の方が有利です。同じ面積の住宅なら平屋より2階建てが、凸凹のある住宅よりより四角に近い住宅の方が有利です。
かといって単にゼロエネのために総2階の家にするのは現実的ではありませんので、総合的な判断をしてプラン考えていく必要があります。